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creativemolecules 002SS說明書

 更新時間:2021-02-01 點擊量:1136

creativemolecules 002SS說明書

 

DTSSP-H8/D8

產(chǎn)品信息DTSSP-H8/D8二硫代琥珀酰亞胺丙酸酯12 x 1 mg DTSSP-H8和DTSSP-D8 NO NO OO SO SO xx xx xx xx xNaO SO3Na 3S x = H-DTSSP-H8 x = D-DTSSP-D8目錄號:編號:002SS分子式:C14H14N2Na2O14S4/C14D8H6N2Na2O14S4分子量:MW 608/616特征:同位素編碼。
水溶性。
化學(xué)可裂解。
CID可裂解。
DTSSP-H8/D8是一種水溶性、同雙功能、同位素編碼的可裂解交聯(lián)劑二硫代磺基琥珀酰亞胺丙酸酯。
試劑的輕(H8)和重(D8)形式的區(qū)別在于重形式的8個氘原子,而不是輕形式的8個氫原子,否則在化學(xué)上是相同的。同位素編碼能夠在質(zhì)譜中明確檢測交聯(lián)產(chǎn)物。DTSSP-H8/D8的反應(yīng)產(chǎn)物將在質(zhì)譜中表現(xiàn)為強度相等的雙峰,對應(yīng)于試劑的輕(H8)和重(D8)形式,以8.05016 Da除以電荷狀態(tài)(+ 1為8.05,+ 2為4.03,+ 3為2.68等)。
在pH 7-9緩沖液中,N-羥基磺琥珀酰亞胺(NHS)酯主要與伯氨基(-NH2)反應(yīng),形成穩(wěn)定的酰胺鍵。因此,交聯(lián)反應(yīng)應(yīng)避免使用含胺的緩沖液(Tris、甘氨酸、銨鹽等)。
DTSSP具有水溶性,可在水中制備貯備液。為制備50 mM DTSSP-H8/D8儲備液,向含有1 mg試劑的預(yù)稱重管中加入33 μL水。

 使用以下公式計算肽交聯(lián)物的質(zhì)量:
[M12+H]+
= [M1+H]+
+[M2+H]+
+172.97310
[M1OH + H]+
= [M1+H]+
+191.99149
[M1i + H]+ =[M1 + H]+
+173.98093
[M1NH2 + H]+
= [M1+H]+
+191.00747
其中,M1、M2-游離肽的質(zhì)量;M12-肽間交聯(lián)的質(zhì)量;M1OH-死端交聯(lián)的質(zhì)量;M1i-
肽內(nèi)交聯(lián);M1NH2–死端酰胺的質(zhì)量(如果用銨鹽淬滅反應(yīng))。
MS-Bridge(http://prospector.ucsf.edu)橋聯(lián)元素組成:C6 H6 O2 S2;–OH的修飾元素組成
末端C6 H8 O3 S2;–NH2末端的修飾元素組成:C6 H9 N1 O2 S2。
FLAG(DYKDDDDK)肽試驗反應(yīng)的典型MALDI質(zhì)譜圖見圖1。
試劑的輕(H8)型反應(yīng)產(chǎn)物為:1013–無FLAG肽;1187–肽內(nèi)交聯(lián);1205–
死端交聯(lián);2199-肽間交聯(lián)。
DTSSP-H8/D8交聯(lián)物可被DTT裂解(圖2)(參考文獻1)或CID(圖3)。在這兩種情況下,
仍用H4/D4原子同位素標(biāo)記交聯(lián),并將在光譜中表現(xiàn)為等強度峰的雙峰分離
除以電荷狀態(tài)4.03 Da。與CID一樣,裂解可以在CID的兩個C-S鍵中的任何一個發(fā)生。
交聯(lián)劑,導(dǎo)致構(gòu)成肽間的每個單獨肽的兩組H4/D4雙鏈被66 Da分開
交聯(lián)(圖3)(參考文獻2、3)。

 

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